chip是谁发明的(吃是谁发明的)

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马铃薯片(potato chip)是谁发明的?

分类: 生活 美食/烹饪

解析:

马铃薯片是怎样发展来的 ?

作为世界性的 食品 , 马铃薯的消耗量仅次于大米。 薄脆的咸薯片是最受欢迎的零食。 马铃薯片起源于 美国的新英格兰 , 作为薯条的一种变体,它并不是厨师的突发奇想,而是为了发泄不满。

1853 年夏天 , 乔治 ( Gee Crum) 在美国纽约 一流的度假胜地 萨拉托加( Saratoga )当厨师 。那里的月亮湖旅馆 餐厅提供 法国式炸马铃薯条, 乔治通常按照标准的法国尺寸制作。这种食品在 17 世纪风靡法国,那时托马斯·杰弗逊是美国驻法大使,他非常喜欢吃薯条。于是就把制作方法带到美国,并在蒙蒂塞洛( Monticello )把炸薯条当作一道正式晚宴菜肴招待客人。

在月亮湖旅馆,一个顾客( 有些文献 称是百万富翁 范德比尔特 )发现厨师乔治做的拆陵槐炸薯条太厚, 他不喜欢,因此拒绝付帐。于是乔治又做了一批薄一点的 ,但同样不能让他满意。被激怒的乔治就决定教训这位客人,他把薯条做得非常薄非常脆,以至于 叉子汪橡都插不起来 。然而, 并没有达到他的预期目的, 客人非常喜欢这种浅黄色、像纸一样薄的马铃薯片。 其他客人也要求乔治为他们做这种薯片。 从此,菜单上出现了 萨拉托加 薯片, 并成为特色食品。

不久 这种薯片 被包装并且出售,刚开始是当地的,然后就风靡整个新英格兰地区。 终于 乔治开了他自己的餐厅,特色就是薯片。 那时 马铃薯要靠手工削皮和切片。 在上世纪二十年代马铃薯削皮机的发明使得薯片从小规模制作变成销售量最大的零食。

几十年后,薯片成了美国东北部 主要的 正餐菜肴。

上世纪二十年代,一个南方的旅行推销员赫尔曼· 雷( Herman Lay ) 帮助推广了这旅友种食品。 他带着皮箱在美国南部的杂货店叫卖,之后便创立了公司,而他的名字几乎成为薯片的同义词。 Lay's 薯片是第一个成功市场化的美国品牌。从六十年代开始,薯片在全世界流行开来。

芯片,半导体和集成电路的区别

1.芯片,又称微电路、微芯片、集成电路(英文:integrated电路,IC).它是指包含集成电路的硅芯片,非常小,往往是计算机或其他电子设备的一部分。芯片是半导体元器件产品的总称。是集成电路(IC,完整的电路)载体,其由晶片分割。硅片是一小片包含集成电路的硅,是计算机或其他电子设备的一部分。2.半导体(半导体)是指室温下电导率介于导体和绝缘体之间的材料。它广泛应用于半导体收音机、电视机和温度测量。例如,二极管是由半导体制成的器件。半导体是指其导电性可以控制的材料,范围从绝缘体到导体。无论从科技还是经济发展的角度来看,半导体的重要性都是巨大的。今天,大多数电子产品的核心单元,如电脑、手机或数码录音机,都与半导体密切相关。常见的半导体材料包括硅、锗、砷化镓等。在各种半导体材料中,硅是商业应用中最有影响力的一种。物质有各种形式,如固体、液体、气体和等离子体。我们通常称导电性差的材料为煤、人造水晶、琥珀、陶瓷等。、绝缘体。具有良好导电性的金属,如金、银、铜、铁、锡和铝,称为导体。导体和绝缘体之间的材料可以简称为半导体。3.集成配塌电路(集成的电路)是一种微型电子培乱圆器件或元件。通过采用一定的工艺,将电路中所需的元器件和布线,如晶体管、电阻、电容、电感等,相互连接在一起,制作在一个陪喊或几个小的半导体晶片或介质基片上,然后封装在一个封装体内,形成具有所需电路功能的微结构;所有元器件在结构上已经集成为一个整体,使电子元器件向小型化、低功耗、智能化、高可靠性迈进了一大步。在电路中用字母“IC”表示。集成电路的发明者有杰克·基尔比(基于锗(Ge)的集成电路)和罗伯特·诺伊斯(基于硅(Si)的集成电路)。现在半导体行业多采用硅基集成电路。

易基因 | ChIP-seq技术简介

染色质免疫沉淀后测序( ChIP seq )是一种针对DNA结合蛋白、组蛋白修饰或核小体的全基因组分析技术。由于二代测序技术的巨大进步,ChIP-seq比其最初版本ChIP-chip具有更高的分辨率、更低的噪声和更大的覆盖范围。随着测序成本的降低,ChIP- seq已成为研究基因调控和表观遗传机制不可或缺的工具。

原理:甲醛处理细胞使目标蛋白与DNA交联,通过超声波将交联后的染色质打断成小片段,一般在200-600bp范围内。再利用抗原抗体的特异性识别反应,将与目的蛋白相结合的DNA片段沉淀下来。最后,去交联并对纯化后DNA进行PCR扩增,高通量测序,最后与已有基因组序列进行比对,以确定    DNA与蛋白质结合的序列。

问题分析:

1.甲醛交联对后续结果分析的影响?

自从Orlando V等人首次发明了ChIP技术,十几年后核心步骤仍无大变化。然而,ChIP-seq技术实际存在一定 的缺陷,例如甲醛交联 。甲醛虽然是一种高度渗透的交联剂,但由于其反应活性仅限于胺,因此其交联效率较低;对哺乳动物细胞而言,其最大交联效率仅为1%。因此甲醛交联细胞所需的起始量很大,也因此该技术也很难适用于微量细胞及单细胞样本。牛津大学出版社发表的文章In vivo formaldehyde cross-linking: it is time for black box analysis指出,某些蛋白质如:阻遏蛋白,NF-κB等无法通过甲醛交联到DNA上,研究表明;在DNA上的停留时间短于5秒的蛋白质无法用甲醛交联。其次,甲醛会导致许多其它无关消和蛋白质交联到DNA上,影响后续分析数据。有报道称,甲醛交联会触发DNA损伤应答机制,从而改变染色体组分,进而使ChIP结果产生偏向性。除此之外,由于交联反应在加热和低PH的情况下会发生逆转,因此DNA蛋与白质的交联复合物的稳定性也是一个值得关注的问题。因此,甲醛究竟枝桥档在多大程度上能反应细胞内蛋白质的分布仍不能确定。

根据有无甲醛交联步骤可以把CHIP技术划分为两种类型,一类是存在甲醛交联的ChIP,即X-ChIP(cross-linking and mechanical shearing ChIP);另一类是无交联存在的ChIP,即N-ChIP(native-ChIP);相较于X-ChIP,N-ChIP技术有一系列的优点,包括:高分辨率(MNase的使用使得染色体的片段化可以小至核小体)、避免了甲醛交联带来的非特异性蛋白在DNA上的富集、避免了甲醛交联对抗原表位的遮盖、步骤的减少降低了样品的损失等。然而,由于使用了MNase,N-ChIP只适用于研究组蛋白修饰,大部分情况下不能用于转录因子的研究。

2. 超声波打断和酶断裂方法的比较?

酶类:  最常用的酶类如 MNase ,即:微球菌核酸酶,是一种能降解核小体连接区的DNA序列的核酸酶,最初从金黄色葡萄球菌中分离出来。MNase消化染色质可以释放出一个个独立的核小体。

MNase酶解法具有一定的局限性,首先,MNase对于偏向于切割A/T碱基位点,导致核小体在A/T富集区域的表达量低于真实情况;其次,MNase不能在核小体边界精确切割,这导致在确定染色质的开放位置与真实情况存在差异;而且,MNase偏向于消化脆性核小体。在不同物种的实验证据表明,脆性核小体占据了基因启动子和转录终止位点,而脆性核小体只在MNase浓度较低且消化时间较短的情况下才能被检测出来,因此很难将脆弱核小体量化到稳定核小体的相对丰度。

超声打断则不如酶裂解法温和,而且由于打断的不均匀性,导致测序结果背景噪音高,影响后续数据分析。由于文章篇幅限制,在此不多赘述。

那么究竟选择酶解还是超声打断,需要视 情况 而定。可参考以下建议:

如果所研猛乱究的蛋白质高丰度表达且与DNA结合紧密如组蛋白,那么样本无需需交联,这时可使用酶解法。

如果所研究的蛋白质表达丰度较低或与DNA结合不紧密如转录因子等,往往需要用交联试剂将样本进行固定,稳定蛋白质和DNA的形态,这时最好选用超声法进行断裂。

拓展:

适用于微量细胞水平的ChIP技术及其原理

1)CUT-Tag技术:

CUT-Tag可同时用于研究转录因子结合位点以及DNA的开放性。可在一天之内完成从细胞到建库完成的所有步骤,且具有高分辨率,低噪音等特点。起始细胞用量可低至50个。[1]

原理:利用抗原抗体特异性反应,加入特异性抗体与染色体上目标蛋白结合,加入二抗与该抗体结合以募集更多的pA-Tn5转座酶复合物至目标蛋白与DNA序列的结合位点上,转座酶复合物切割该染色质开放位点,并在切割后的DNA片段两端加入接头,文库构建完成,可直接进行后续测序,与已有基因组序列比对,即可知道目标蛋白与DNA的结合位点。

2)ChIL-seq:

ChIL(chromatin integration labelling),即染色质集成标签技术,可同时用于研究转录因子结合位点以及DNA的开放性,起始细胞用量为100-1000个细胞。ChIL-seq 避免了传统ChIP-seq技术中由于抗体沉淀所带来的回收率低的缺陷,尤其适用于贴壁细胞。对于活跃的组蛋白标记如H3K4me3 ,H3K27ac,起始细胞用量甚至可降低至单细胞水平。[2]

原理:在96孔板中加入细胞,经固定,染色后加入一抗与目标蛋白结合,随后加入ChIL探针(由二抗和ChIL DNA组成),探针中的ChIL DNA经Tn5转座酶整合到目标蛋白所在基因组DNA附近,随后T7 RNA 聚合酶经ChIL DNA中的启动子启动转录,以此处基因组DNA为模板合成RNA,经DNase I消化和裂解释放RNA,以纯化的RNA建库测序。

3.Drop-ChIP:

Drop-ChIP:使用了特定的微流控装置,分辨率可达到单细胞水平。该技术不仅可以在单细胞水平研究转录因子结合位点及组蛋白修饰,还可以从细胞特异性角度研究不同细胞间染色质的变异程度。我们认为,整合单细胞染色质和单细胞表达数据,可以使调控元件与靶基因更精确地耦合,并更深入地了解它们的功能动力学和关系。[3]

原理:首先,将待研究的细胞与裂解液,MNase混合进行染色质消化,另外设计一个包含很多种不同接头的液滴,在微流控装置上反应,使得每一个细胞液滴与一种接头液滴混合,同时与含有DNA连接酶的buffer液滴混合。这个过程中,接头序列自动连接到裂解的染色质片段两端,进而进行细胞裂解,使用特异性抗体对目标蛋白进行沉淀,对富集后的DNA进行测序。与已有基因组序列比对即可知道目标蛋白作用位点。

[1]. 1: Kaya-OkurHS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG, Ahmad K,Henikoff S.CUTTag for efficient epigenomic profiling of small samples and singlecells. Nat Commun. 2019 Apr 29;10(1):1930.

[2]. Harada A,Maehara K, Handa T, Arimura Y, Nogami J, Hayashi-Takanaka Y, Shirahige K,Kurumizaka H, Kimura H, Ohkawa Y. A chromatin integration labelling method enablesepigenomic profiling with lower input. Nat Cell Biol. 2019 Feb;21(2):287-296.

[3]. Rotem A, RamO, Shoresh N, Sperling RA, Goren A, Weitz DA, Bernstein BE. Single-cellChIP-seq reveals cell subpopulations defined by chromatin state. Nat Biotechnol. 2015Nov;33(11):1165-72

生物信息学领域中,有哪些不得不知道的大牛教授/研究者

作者:知乎用户

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来源:知乎

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genomics或者说测序依然是很大的领域,其中的方向细分依然是很多的。genomics整体可以分成两大类,一类主要做方法,一类主要做生物。前者一般使用public data做一些方法,后者主要使用现有的技术研究生物问题。如果说大牛一般都在后一类里面。但是也会有很多不同的方向,比如研究rna的,dna的,基因调控的。所以最好根据自己关注的方向去找。

一个很直接找genomic方向大牛的方法就是看encode,roadmap和4D nuckesomes这些大genomic cobsortium的主要pi。当然也有很多牛人不在这些项目里面。下面简单说几个比较熟悉的,欢迎纠正如岁和补充。

Eric Lander

Broad的创始人,人类基因组计划发起人之一,不过现在自己lab似乎不做大多了,但很多broad的paper还会挂名。

John Rinn

Broad的橘橡贺PI,研究lncRNA。最早发现了H19。

Michell Guttman

Eric Lander的学生,和John Rinn一起发现了lncRNA,在clatech独立不久。

Howard Chang

主要研究RNA,John Rinn的postdoc老板。

Michael Synder

研究基因调控,具体方向很多,组特别大。

Job Dekker

3D genome领域的开拓者,3C,5C和HiC的发明者。

Bing Ren

最早开发了chip-chip技术,研究enhancer,现在做更多3D genome。

Joe Ecker

最早是植物领域的大牛,后来转到做甲基化。

Chuan He

化学出身,之前做DNA甲基化,现在开创了RNA甲基化的新领域。

Mark Gersrein

比较少的主要做计算的大牛,各种network和system biology

Menolis Kellis

Eric Lander的学生,主要做计算也做实验,各种consortium都很活跃。

John Stam

名字很长很难写,主要做DHS,当然还有很多其圆派他方向。

Shirely Liu

主要做计算,lab开发了MACS

chip,french fries,crisp

Chips: 美语:炸土豆片;英语:炸薯条.

French Fries: 美语:炸薯条. (英国人不用这个词)

Crisps: 英语:炸土豆片. (美国人不用这个词)

chip:一种以马铃薯为原料,源起于比利时,切成条状后油炸而成的食品,是现在最常见的快餐食品和族禅之一,流行于世界各地。(长条状的)

french fries:马铃薯片”,可用作不可数名词,也可穗做用作可数名词。用于比喻可作“微不足道的人或物”(片状的)

Crisps:各式洋芋片,各式薯片,各式土豆片,油炸土豆片(片状的)

chip的含义:

(木唤尘头、玻璃等的)缺口,缺损处the place from which a small piece of wood, glass, etc. has broken from an object

(木头、玻璃等破损后留下的)碎屑,碎片,碎渣a small piece of wood, glass, etc. that has broken or been broken off an object

油炸土豆条;炸薯条a long thin piece of potato fried in oil or fat

油炸土豆片;炸薯片a thin round slice of potato that is fried until hard then dried and eaten cold. Chips are sold in bags and have many different flavours.

(作赌注用的)筹码a small flat piece of plastic used to represent a particular amount of money in some types of gambling

(高尔夫球)近穴击球,切削击球;(足球)撮球an act of hitting or kicking a ball high in the air so that it lands within a short distance

以上内容参考:必应词典-chip

通过上述对chip是谁发明的和吃是谁发明的的解读,相信您一定有了深入的理解,如果未能解决您的疑问,可在评论区留言哟。

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